本研究院非常重视产学科合作，在成果转化方面成效突出。
（1）创建了蜂胶活性因子SU梯度提取技术。通过成果转化，将江苏省培养成为我国最大的蜂胶活性因子SU梯度提取产业化基地（泰州、镇江） ，培养出第一该领域的新三版上市公司（江苏江大源生态）。
（2）发明了蛋白多模式超声辅助酶解制备功能多肽系列新技术，揭示出超声促进降血压肽片断释放的靶向作用机制，建成了国际上第一条超声辅助酶解制备功能多肽的生产线（江苏天琦），实现了菜籽多肽的规模化生产，开创了菜籽饼粕食用化开发利用的先河。开发出菜籽多肽、玉米多肽、胶原多肽、麦胚多肽、大米多肽、牛奶多肽、紫菜多肽、谷朊多肽、葵花籽多肽、芝麻多肽等新产品28个。
（3）创建了食品催化式红外加工系列新技术。获得江苏省成果转化专项资金的资助（800万元无偿资助+200万元贴息贷款，江苏李工果蔬机械）、农业部创新条件建设项目“农业部蔬菜脱水加工技术集成基地”（总投资1066万元，江苏大学），目前正在加速推进成果的应用推广。